توپولوژی ساختار دامین اتصال مولیبدوپترین در گزانتین اکسیداز انسانی

نویسندگان

علی اصغر رستگاری

rastegari department of molecular and cell biochemistry, faculty of biology, islamic azad university, falavarjan branch, isfahan, i. r. iran.گروه بیوشیمی سلولی و مولکولی، دانشکده زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد فلاورجان، اصفهان

چکیده

سابقه و هدف: دامین­ها اساس واحدهای عملکردی پروتئین­ها هستند. اطلاعات برهم­کنش دامین-دامین برای فهم حزئیات بر هم­کنش­های پروتئین - پروتئین، عملکرد سلول و فرآیندهای بیولوژیکی مطلوب است. آنزیم­های مولیبدوپترین در محدوده وسیعی از سیستم­های حیاتی در دهه­های مختلف شناسایی شده­اند. این آنزیم­ها نه تنها تسهیم­کننده مشترک دورنمای ساختاری، بلکه آشکار کننده توپولوژی­های تاخوردگی پلی­پپتیدهای متفاوت می­باشند. مواد و روش­ها: بر اساس توالی­های مترادف، 6 خانواده از آنزیم­ها مشمول کوفاکتور مولیبدنیم مشخص شده است. دامین­های ساختاری متمرکز شده، شاخص روشنی را برای ارتباطات ساختاری فراهم می­کنند که ناشی از نتایج درختچه­های فیلوژنی به­عنوان انعکاسی از عملکرد می­باشد. اغلب این فرآیند از مقایسه پروفایل­های توالی پروتئین یا مدل­های مخفی مارکوف حاصل می ­ شود. توانایی روش­های پیش­گویی را با استفاده از محل­های برهم­کنش به­عنوان تداخل­های هدف نشان می­دهیم. نتایج: امکان پیش­گویی محل­های برهم­کنش دامین با صحت و درستی زیاد با استفاده از اطلاعات توالی است. نتیجه­گیری: این الگوریتم­ها و آنالیزهای ارائه شده، پیشرفت شاخصی از توانایی مدل را برای تعیین دامین اتصال مولیبدوپترین و درک بیشتری از ارتباط بین تکامل توالی متمرکز شده و خواص ساختمان – عمل پروتئین ­ها فراهم می­کند.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

اندازه‌گیری اثر مهاری عصاره‌ آبی هفت گیاه دارویی بر فعالیت آنزیم گزانتین اکسیداز به روش برون‌تنی

تولید بیش از اندازه اسید اوریک بوسیله آنزیم گزانتین اکسیداز باعث بروز بیماری نقرس می‌شود. مهارکننده‌های این آنزیم ازجمله داروی آلوپورینول از مهمترین داروهای ضد نقرس موجود می‌باشند. گیاهان دارویی ازجمله منابع طبیعی در دسترس هستند که ممکن است در درمان نقرس مؤثر و مفید باشند. در این مطالعه اثر مهاری عصاره آبی گیاهان کنگر فرنگی (Cynara scolymus L.)، بادیان رومی (Trachyspermum copticum (L.) Link)، ب...

متن کامل

بررسی اثر دریافت آلبالو در مقایسه با آلوپورینول بر سطح اسیداوریک سرم، بیومارکرهای استرس اکسیداتیو و فعالیت کبدی آنزیم گزانتین اکسیداز/گزانتین دهیدروژناز در موش‌های صحرایی هایپراوریسمیک

زمینه و هدف کنترل تولید اسیداوریک مهم‌ترین عامل پیشگیری کننده و درمان‌کننده هایپراوریسمی است. هدف از این مطالعه، بررسی اثر تجویز خوراکی آلبالو در مقایسه با آلوپورینول بر سطح اسیداوریک سرم، بیومارکرهای استرس اکسیداتیو (ظرفیت توتال آنتی‌اکسیدانی و میزان پراکسیداسیون لیپیدی) و فعالیت کبدی آنزیم گزانتین اکسیداز/دهیدروژناز در موش صحرایی نرمال و هایپراوریسمیک بود. روش بررسی 36 سر موش صحرایی نر از گون...

متن کامل

تعیین دامین های کارکردی و مدل توپولوژی ژن دلتا 6 دسچوراز غشائی قارچ Mortierella alpina

دسچورازها (EC: 1.14.19.3) کاتالیزگرهای واکنش دهیدروژناسیون بوده و باعث ایجاد پیوند دوگانه در زنجیره اسیدچرب می‌شوند. این آنزیم‌ها به دو گروه محلول و غشائی تقسیم گردیده، هر یک دارای موتیف‌های متفاوتی می‌باشند. با اینکه دلتا 6 دسچوراز آنزیم کلیدی در بیوسنتز اسیدهای‌چرب غیراشباع می‌باشد، ولی بخاطر غشایی بودن، ساختار کریستالی و سه‌بعدی آن تعیین نگردیده است. قارچ Mortierella alpina منبع غنی تولید اس...

متن کامل

تعیین دامین های کارکردی و مدل توپولوژی ژن دلتا 6 دسچوراز غشائی قارچ Mortierella alpina

دسچورازها (EC: 1.14.19.3) کاتالیزگرهای واکنش دهیدروژناسیون بوده و باعث ایجاد پیوند دوگانه در زنجیره اسیدچرب می‌شوند. این آنزیم‌ها به دو گروه محلول و غشائی تقسیم گردیده، هر یک دارای موتیف‌های متفاوتی می‌باشند. با اینکه دلتا 6 دسچوراز آنزیم کلیدی در بیوسنتز اسیدهای‌چرب غیراشباع می‌باشد، ولی بخاطر غشایی بودن، ساختار کریستالی و سه‌بعدی آن تعیین نگردیده است. قارچ Mortierella alpina منبع غنی تولید اس...

متن کامل

ارتباط میان آنزیم‌های گزانتین اکسیداز و گلوتاتیون پراکسیداز با گرفتگی عروق کرونری

Background & Aims: Considering the high prevalence of cardiovascular disease among people in the world, the aim of this study was to simultaneously investigate the association between the serum level of xanthine oxidase and glutathione peroxidase enzymes with the severity of coronary artery disease. Materials & Methods: In this case-control study, 85 patients undergoing coronary artery angiogr...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
فیض

جلد ۱۶، شماره ۷، صفحات ۷۷۵-۷۷۶

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023